Parceria:
Aluna PPGCM: Mirela Verza
Orientadores: Afrânio Kritski (UFRJ) e Maria Luiza Bazzo (LBMMS - UFSC)
Orientador exterior: João Perdigão (Instituto de Investigação do Medicamento, Faculdade de Farmácia, Universidade de Lisboa, Portugal)
Projeto: Epidemiologia Genômica de Mycobacterium tuberculosis na Grande Florianópolis
Destaques: No dia 14 de janeiro de 2020 iniciou-se as atividades do Doutorado-sanduíche de 6 meses no Instituto de Investigação do Medicamento da Faculdade de Farmácia da Universidade de Lisboa em Portugal sob a orientação do Dr. João Perdigão.
Foi apresentado os resultados do doutorado gerados até o momento a fim de organizar um fluxo de trabalho. Considerou-se iniciar as atividades pela análise estatística e posteriormente a análise bioinformática. Os resultados dessas análises encontram-se descritos no artigo científico “Genomic epidemiology of Mycobacterium tuberculosis (M.tb) in Santa Catarina, Southern Brazil” publicado na revista Scientific Reports. Esse artigo teve como objetivo desvendar os genótipos de M.tb circulantes na região da Grande Florianópolis (Santa Catarina), inferir sobre clusters de transmissão existentes e ativos na comunidade, examinar a distribuição da resistência aos medicamentos e explorar possíveis associações entre desfechos desfavoráveis do tratamento e linhagens baseadas em Single-Nucleotide Polymorphism (SNP), utilizando dados gerados no Sequenciamento Completo do Genoma (WGS) de 151 isolados de M.tb. Utilizando um cutoff de 5SNPs foi delineado 22 clusters genômicos na região em estudo. De uma maneira geral os principais clusters encontrados apresentaram-se distribuídos uniformemente na Grande Florianópolis, sendo o maior cluster, Cluster Genômico 1 (GC1) - responsável por 7,9% dos casos analisados - mostrou-se amplamente distribuído geograficamente quando a residência do paciente foi considerada. Foi observado uma maior concentração de casos de TB entre os pacientes residentes nos bairros localizados na região central de Florianópolis. No entanto, a distribuição dos casos com isolados em clusters não apresentou nenhum padrão particular de agrupamento geográfico, pois os pacientes cujos isolados foram agrupados apresentaram uma ampla dispersão geográfica na região estudada.
Neste estudo, realizou-se uma análise da diversidade genética e da transmissão recente de M.tb no estado de Santa Catarina baseado no WGS, aumentando o conhecimento sobre a dinâmica da TB nesse cenário e preenchendo a falta de dados genômicos das cepas de M.tb circulantes em Santa Catarina. Os dados mostraram que ocorreu transmissão não controlada de TB na região metropolitana de Florianópolis, isso pode estar relacionado com estirpes pertencentes às principais cadeias de transmissão aqui identificadas, sendo que dados mais recentes mostram um aumento na taxa de incidência de TB na região (43,5% em 2016 para 46,0% em 2018). Esses dados enfatizam a importância da epidemiologia molecular como instrumento de vigilância da TB e apoio a medidas de saúde pública no controle da doença na região.
Além de todo conhecimento técnico adquirido no Doutorado-sanduíche, tive a oportunidade de participar do “II Simpósio de Investigação em Tuberculose e Micobactérias não tuberculosas em Portugal”, realizado na Faculdade de Farmácia na Universidade de Lisboa. Tratou-se de um evento que reúne diversos especialistas nacionais para debaterem temas atuais da área expondo trabalhos científicos alusivos a mesma. Entre os principais temas abordados foram: tuberculose, clínica e saúde pública, epidemiologia molecular do M. tb, evolução e genômica, interação micobactérias-hospedeiro, invólucro das micobactérias - novos alvos terapêuticos e implicações na resistência a antibióticos e diagnóstico e novas abordagens terapêuticas.
Não podia deixar de relatar aqui, a experiência de lockdown durante o período da pandemia do COVID-19. Durante o isolamento de 3 meses foi finalizado a escrita do artigo e repassado aos coautores, na sequência foi realizada a correção dos comentários dos coautores e submissão para revista. Consequentemente foi realizada a correção dos revisores da revista e finalmente obtivemos o aceite para publicação. Durante esse período fui gentilmente assistida pelo orientador do exterior Dr. João Perdigão. O resultado do aprendizado gerado no Doutorado-sanduíche está compilado no artigo científico “Genomic epidemiology of Mycobacterium tuberculosis in Santa Catarina, Southern Brazil” publicado na revista Scientific Reports. O retorno ao Brasil foi no dia 15 de julho de 2020 e a tese de doutorado foi defendida em 11 de dezembro de 2020.
Confira as fotos:
